Lezione 10: Traduzione Flashcards
(45 cards)
Quante combinazioni di codoni ci sono nel codice genetico?
64 combinazioni (4^3: 4 BA e 3 posti)
Che vuol dire che il codice genetico è
-degenerato
-ridondante
-degenerato—-> ci sono 64 combinazioni per 20 aa (61 codificano per 1 aa, gli altri 3 codoni sono codoni di stop)
-ridondante—-> 1 aa può essere codificato da più di un codone
Qual è la struttura del tRNA?
Stem loop (trifoglio)—-> 4 segmenti ripiegati a formare una doppia elica
*estremità 3’—-> attacco dell’aa
*braccio T
*braccio D
*anticodono complementare al copione dell’mRNA
(Ricorda: la I BA dell’mRNA si lega con la III BA del tRNA e così via)
Che tipo di BA trovo nelle vari posizioni posizioni dell’anticodone del tRNA?
-Nelle posizioni 3 e 2 ci sono le classiche 4 basi (A, U, G, C,)
-Nella posizione 1 c’è l’inosina (ottenuta dalla DEAMINAZIONE dell’adenosina)—-> per questo il legame con la terza base dell’mRNA non è perfetto
Chi produce il tRNA?
RNApol III
Il tRNA può essere sottoposto a splicing?
Sì, ma è diverso dallo splicing dell’mRNA (non si forma un CAPPIO, ma c’è un meccanismo TAGLIA e CUCI)
Quanti tipi di aa può trasportare 1 tRNA?
Solo 1
Un aa può essere trasportato da più tRNA?
Sì (perchè ci sono più codoni per 1 aa)
Quanti sono i frame di lettura di un tRNA?
3
Dimmi 4 funzioni dei lncRNA (long non coading RNA)
-formano stem loop
-nel citoplasma sono effetti oro allosterici del metabolismo
-nel nucleo marcano precise posizioni del genoma
-sono coinvolti nei processi ribonucleoproteici
Dimmi 4 cose sui ribosomi
- è un ribozima
-formato da rRNA (parte funzionale) e proteine (fungono solo da impalcatura per stabilizzare rRNA)
-hanno 2 subunità:
*maggiore (60s)—->3 RNA
*minore (40s)—-> 1 RNA
-la subunità maggiore ha 3 siti:
A/P/E
Cosa sono i poli ribosomi?
Sono più ribosomi che si attaccano ad 1 solo mRNA e traducono contemporaneamente la stessa sequenza
(LA TRADUZIONE AVVIENE SOLO TRAMITE POLIRIBOSOMI!!!)
Come fa l’mRNA a diventare ciclico per entrare nei poliribosomi?
Come avviene la traduzione tramite i poliribosomi?
In quanti passaggi avviene il legame tra aa e tRNA?
Quale enzima catalizza il legame tra aa e tRNA? Che tipo di legame è?
-enzima:Amminoacido tRNA sintetasi (usa idrolisi ATP!)
-legame estere tra il COOH dell’aa e l’OH del C3’ dello zucchero del tRNA
Quanti tipi di amminoacido tRNA sintetasi esistono?
2 tipi:
-una unisce l’amminoacido direttamente al gruppo 3’-OH del ribosio,
- l’altra unisce l’aa inizialmente al gruppo 2’-OH. In
quest’ultimo caso una successiva reazione di transesterificazione sposta l’amminoacido nella posizione 3’.
Cosa succede all’inizio della traduzione?
1)La subunità minore del ribosoma recluta:
*tRNA iniziatore-metionina (Mert-tRNA)
*fattori di inizio eucariotici (eIF)
2) la subunità minore del ribosoma si lega all’estremità 5’ dell’mRNA (riconosce il cap grazie ad eIF4E/eIF4G)
3) scanning—-> la subunità minore scivola sull’mRNA fin quando non trova il primo codone AUG
4) arriva la subunità maggiore e si assembla il ribosoma
Da cosa è costituito il complesso di pre inizio della traduzione?
Met-tRNA+ subunità minore del ribosoma+ fattori di inizio
Cos’è la sequenza Kozak?
Sequenza dell’mRNA che circonda AUG (così il codone viene riconosciuto più facilmente dal ribosoma)
La sequenza è G/ANNAUGG
RICORDA: questa è una sequenza non obbligatoria per la traduzione, ma la rende più efficiente
Cosa sono gli IRES?
Sono gli Internal Ribosome Entry Sites—-> sequenze speciali nell’mRNA che permettono al ribosoma di iniziare la traduzione da un AUG posto in un punto interno dell’RNA, senza dover passare per il cap
In quale organismo vennero individuati gli IRES per la prima volta?
In che processi trovo gli IRES nelle cellule umane?
Qual è l’enzima che catalizza la formazione del legame peptidico nel ribosoma? Che tipo di reazione è?
-enzima:Peptidil transferasi (è un dominio dell’RNA 23S della subunità grande del ribosoma!!!)
-reazione: trans esterificazioneò
