Kolokwium I - enzymy cz.1

Question 1

Czym są enzymy?

Answer 1

biokatalizatorami

Question 2

Jakie wyróżniamy rodzaje enzymów ze względu na strukturę jaka je tworzy?

Answer 2

• białka (globularne)

- rybozymy (kwasy rybonukleinowe)

Question 3

Czy enzymy białkowe katalizują reakcję same czy z udziałem innych czynników?

Answer 3

• część enzymów funkcjonuje samodzielnie (bez dodatkowego udziału czynników niebiałkowych)
• cześć enzymów wymaga udziału niebiałkowych kofaktorów

Question 4

Jak nazywamy enzym, który działa przy udziale kofaktora w stanie niezwiązanym z kofaktorem = nieaktywnym?

Answer 4

apoenzym

Question 5

Jak nazywa się apoenzym związany z kofaktorem?

Answer 5

holoenzym = aktywny

Question 6

Co to jest kofaktor?

Answer 6

niebiałkowy związek chemiczny, potrzebny danemu enzymowi do katalizowania określonej reakcji chemicznej

Question 7

Jakie wyróżniamy rodzaje kofaktorów?

Answer 7

• grupy prostetyczne
• koenzymy
• jony metali

Question 8

Czym charakteryzują się grupy prostetyczne?

Answer 8

są silnie, kowalencyjnie związane z enzymami

Question 9

Czym charakteryzują się koenzymy?

Answer 9

• są luźno, niekowalencyjnie związane z enzymami

- są pochodnymi witamin

Question 10

Jakie jony metali mogą występować jako kofaktory?

Answer 10

Zn2+, Mg2+, Mn2+, Cu+/2+, Mo2+, Ca2+

Question 11

Z ilu podjednostek składają się enzymy?

Answer 11

mogą być jedno- lub wielopodjednostkowe

Question 12

Co jest szczególnie ważną częścią enzymu?

Answer 12

miejsce aktywne

Question 13

Jakie zadanie pełni miejsce aktywne enzymu?

Answer 13

ułatwia zajście reakcji

Question 14

Co ma wpływ na aktywność miejsca aktywnego enzymu?

Answer 14

kształt i środowisko chemiczne

Question 15

Z czego składa się centrum aktywne enzymu?

Answer 15

• szczelina lub zagłębienie (niedostępne dla cząsteczek wody)
• układ przestrzenny reszt aminokwasowych z grupami polarnymi

Question 16

Jaką funkcję pełni szczelina lub zagłębienie miejsca aktywnego enzymu, które są niedostępne dla cząsteczek wody?

Answer 16

zapewnia hydrofobowe mikrośrodowisko

Question 17

Jaką funkcję pełni układ przestrzenny reszt aminokwasowych z polarnymi grupami miejsca aktywnego enzymu?

Answer 17

grupy polarne biorą udział w wiązaniu substratu i katalizie

Question 18

Jaki jest stosunek wielkości enzymu do swoistych substratów?

Answer 18

enzymy są dużo większe

Question 19

Jakie bariery termodynamiczne i fizykochemiczne musi pokonać enzym by utworzyć kompleks enzym-substrat?

Answer 19

• rozproszenie i ruchliwość cząsteczek
• uwodnienie substratu
• stabilność utrwalonej struktury substratów

Question 20

Jakie wyróżniamy modele oddziaływania enzym-substrat?

Answer 20

• model zamka i klucza

- model wzbudzonego dopasowania

Question 21

Jakie efekty wiążą się ze zbliżeniem i odpowiednim ustawieniem substratów względem centrum aktywnego enzymu?

Answer 21

efekty entropijne

Question 22

Jakie znaczenie ma istnienie hydrofobowego mikrośrodowiska w centrum aktywnym enzymu?

Answer 22

wzmacnia oddziaływania wewnątrz centrum

Question 23

Jakie znaczenie ma wywołanie naprężeń i odkształceń w substracie podczas działania enzymu?

Answer 23

uzyskanie i stabilizacja stanu przejściowego

Question 24

O czym stanowi wejście do miejsca aktywnego enzymu?

Answer 24

o swoistości enzymu

Question 25

Jak działają enzymy?

Answer 25

katalizują reakcję obniżając energię aktywacji

Question 26

Czy mechanizm reakcji ma wpływ na ΔG?

Answer 26

nie

Question 27

W jaki sposób enzymy wpływają na stabilność stanu przejściowego i jaki to ma wpływ na szybkość reakcji?

Answer 27

enzymy przyspieszają reakcję przez stabilizację stanu przejściowego

Question 28

Jakie cechy określają enzymy jako katalizatory?

Answer 28

- sprawność - swoistość - funkcjonowanie w łagodnych warunkach - możliwość regulowania aktywności

Question 29

Względem czego może występować specyficzność enzymów?

Answer 29

- względem substratu | - względem katalizowanej reakcji

Question 30

Co jest podstawą klasyfikacji enzymów?

Answer 30

rodzaj katalizowanej reakcji

Question 31

Jakie wyróżniamy klasy enzymów?

Answer 31

1. oksydoreduktazy 2. transferazy 3. hydrolazy 4. liazy 5. izomerazy 6. ligazy (syntetazy)

Question 32

Jakie wyróżniamy podklasy oksydoreduktaz?

Answer 32

- dehydrogenazy - reduktazy - oksydazy - oksygenazy - peroksydazy - katalazy

Question 33

Jakie wyróżniamy podklasy transferaz?

Answer 33

- transaldolazy i transketolazy - metylo-, acylo-, glukozylo-, amino-, i fosfotransferazy - kinazy - fosfomutazy - syntazy

Question 34

Jakie wyróżniamy podklasy hydrolaz?

Answer 34

- esterazy - fosfatazy - glikozydazy - peptydazy - tiolazy - fosfolipazy - nukleazy - lipazy

Question 35

Jakie wyróżniamy podklasy liaz?

Answer 35

- dekarboksylazy - aldolazy - hydratazy - dehydratazy - syntazy

Question 36

Jakie wyróżniamy podklasy izomeraz?

Answer 36

- racemazy - epimerazy - mutazy

Question 37

Jakie wyróżniamy podklasy ligaz?

Answer 37

- karboksylazy - ligazy - syntetazy

Question 38

Jakie reakcje katalizują oksydoreduktazy?

Answer 38

utleniania i redukcji

Question 39

Jakie koenzymy są związane z podklasą dehydrogenaz?

Answer 39

``` NAD+ NADP+ FAD FMN DPT liponian ```

Question 40

Jakie koenzymy związane są z podklasą oksydaz?

Answer 40

FAD i FMN

Question 41

Jakie reakcje katalizują dehydrogenazy?

Answer 41

utleniania i redukcji z odczepieniem atomu wodoru

Question 42

Jakie reakcje katalizują oksydazy?

Answer 42

przenoszenie wodoru na tlen w wyniku czego powstaje woda lub nadtlenek wodoru

Question 43

Jakie reakcje katalizują oksygenazy?

Answer 43

wbudowania tlenu w cząsteczkę

Question 44

Jakie wyróżniamy rodzaje oksygenaz?

Answer 44

monooksygenazy i dioksygenazy

Question 45

Jakie koenzymy związane są z monooksygenazami?

Answer 45

NADP+ hem (cyt P450) witamina C

Question 46

Jakie reakcje katalizują monooksygenazy?

Answer 46

włączenie jednego atomu tlenu do hydroksylowanego substratu, podczas gdy drugi atom tlenu wiązany jest w cząsteczkę wody z udziałem NAD(P)H

Question 47

Jakie reakcje katalizują dioksygenazy?

Answer 47

włączają dwa atomy tlenu do substratu

Question 48

Jak inaczej nazywamy monooksygenazy?

Answer 48

hydroksylazy

Question 49

Jaki specyficzny aminokwas zawiera peroksydaza glutationowa?

Answer 49

selenocysteinę

Question 50

Jaką reakcję katalizuje katalaza?

Answer 50

2H2O2 → 2H2O + O2

Question 51

Jakie reakcje katalizują peroksydazy?

Answer 51

utlenianie nadtlenkiem wodoru różnych substratów

Question 52

Jakie reakcje katalizują transferazy?

Answer 52

reakcje przenoszenia fragmentów substratów

Question 53

Jakie koenzymy są związane z aminotrasferazami?

Answer 53

fosforan pirydoksalu (PLP)

Question 54

Jakie reakcje katalizują aminotransferazy?

Answer 54

transaminację grup α-aminowych z α-aminokwasów na α-ketokwasy

Question 55

Jakie reakcje katalizują kinazy?

Answer 55

reakcję przeniesienia grupy fosforanowej ze związku wysokoenergetycznego (np. ATP) na właściwą cząsteczkę docelową

Question 56

Jak nazywamy reakcję, którą katalizują kinazy?

Answer 56

fosforylacja

Question 57

Jakie reakcje katalizują hydrolazy?

Answer 57

reakcje hydrolitycznego rozszczepienia substratów (= z udziałem cząsteczki wody)

Question 58

Jakie koenzymy związane są z hydrolazami?

Answer 58

hydrolazy nie wiążą się z koenzymami

Question 59

Jakie reakcje katalizują liazy?

Answer 59

odłączanie grup bez udziału cząsteczki wody lub dołączanie grup do wiązań podwójnych

Question 60

Co jest koenzymem dekarboksylazy pirogronianowej?

Answer 60

DPT

Question 61

Jakie reakcje katalizują izomerazy?

Answer 61

przekształcania substratu w jego izomer

Question 62

Jakie reakcje katalizują racemerazy?

Answer 62

zmieniają położenie podstawników przy atomie węgla decydującym o przynależności do szeregu D lub L

Question 63

Jakie reakcje katalizują epimerazy?

Answer 63

zmieniające położenie podstawników przy asymetrycznym atomie węgla

Question 64

Jakie reakcje katalizują mutazy?

Answer 64

zmieniające położenie reszty fosforylowej

Question 65

Jakie reakcje katalizują dekarboksylazy?

Answer 65

odłączenie dwutlenku węgla od grupy karboksylowej kwasów organicznych

Question 66

Jakie reakcje katalizują ligazy?

Answer 66

reakcje łączenia substratów w sprzężeniu z hydrolizą związku wysokoenergetycznego

Question 67

Jakie reakcje katalizują karboksylazy?

Answer 67

powstawanie wiązań chemicznych węgiel-węgiel (C-C) pomiędzy cząsteczkami (przy użyciu energii w postaci ATP)

Question 68

Jaki koenzym jest związany z karboksylazą pirogronianu?

Answer 68

biotyna