Kolokwium II - synteza i przekształcanie RNA

Question 1

W jaki sposób odbywa się biosynteza deoksyrybonukleotydów?

Answer 1

poprzez redukcję zsyntetyzowanych rybonukleotydów

Question 2

Jaką strukturę przypominają odcinki dwuniciowego RNA?

Answer 2

A-DNA

Question 3

W jakiej formie zasadniczo występuje komórkowe RNA?

Answer 3

jako rybonukleoproteiny (RNA zasocjowane z białkami)

Question 4

Dla jakiej długości fali RNA wykazuje charakterystyczną absorpcję?

Answer 4

260nm

Question 5

Czy polimerazy RNA wymagają startera?

Answer 5

nie potrzebują

Question 6

Z jakich podjednostek składa się polimeraza RNA?

Answer 6

α, β, β’ i σ

Question 7

Które podjednostki stanowią rdzeń polimerazy RNA?

Answer 7

αββ’

Question 8

Z jakich części składa się holoenzym polimerazy RNA?

Answer 8

z rdzenia i sigma faktora

Question 9

Jaką funkcję pełni podjednostka β polimerazy RNA?

Answer 9

tworzy wiązania fosfodiestrowe

Question 10

Jaką funkcję pełni podjednostka B’ polimerazy RNA?

Answer 10

wiąże nić matrycową DNA

Question 11

Jaką funkcję pełni sigma faktor polimerazy RNA?

Answer 11

rozpoznaje promotor i ułatwia inicjację

Question 12

Co to jest sekwencja Shine-Dalgarno (SD)?

Answer 12

sekwencja, która łączy się z komplementarną, bogatą w pirymidyny sekwencją w 16S rRNA ułatwiając inicjację translacji

Question 13

W jakie nukleotydy bogata jest sekwencja Shine-Dalgarno?

Answer 13

purynowe

Question 14

Co powstaje z laktozy pod wpływem działania β-galaktozydazy?

Answer 14

glukoza i galaktoza

Question 15

Co wiąże promotor laktozowy E. coli?

Answer 15

CAP i polimerazę RNA

Question 16

Co wiąże operator laktozowy E. coli?

Answer 16

represor lac

Question 17

Jaką funkcję pełni operon laktozowy?

Answer 17

umożliwia produkcję enzymów niezbędnych do metabolizowania laktozy

Question 18

Jaki rodzaj kontroli pełni operon laktozowy?

Answer 18

kontrola negatywna

Question 19

Z jakich części składa się operon laktozowy?

Answer 19

promotor-operator

Question 20

Z ilu podjednostek składa się lac represor?

Answer 20

z 4 (jest tetramerem)

Question 21

Do czego prowadzi związanie lac represora z operatorem?

Answer 21

uniemożliwia przyłączenie polimerazy RNA do promotora

Question 22

Jak nazywa się związek pośredni w hydrolizie laktozy?

Answer 22

allolaktoza

Question 23

Co się dzieje z allolaktozą jeśli pojawia się w komórce?

Answer 23

wiąże się z podjednostkami lac represora

Question 24

Co się dzieje z represorem podczas wiązania allolaktozy?

Answer 24

zmienia się jego konformacja i zmniejsza powinowactwo do operona

Question 25

Kiedy represor lac oddysocjowuje od cząsteczki DNA?

Answer 25

gdy z wysztykimi podjednostkami zwiąże się allolaktoza

Question 26

Jaki typ kontroli prezentuje operon laktozowy przy obecności laktozy a braku glukozy?

Answer 26

kontrola pozytywna

Question 27

Co syntetyzują komórki gdy nie mają dostępu do glukozy?

Answer 27

cAMP

Question 28

Co stanowi pozytywny regulator operonu katabolicznego (lac operon)?

Answer 28

cAMP

Question 29

Co zwiększa powinowactwo CAP do promotora?

Answer 29

związanie z cAMP

Question 30

Co ułatwia wiązanie polimerazy RNA do promotora?

Answer 30

związanie CAP

Question 31

Kiedy operon laktozowy umożliwia transkrypcję i translację?

Answer 31

po związaniu CAP i polimerazy RNA

Question 32

Ile typów polimeraz RNA występuje u eukariota?

Answer 32

trzy

Question 33

Ile typów polimeraz RNA występuje u prokariota?

Answer 33

jedna

Question 34

Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA I?

Answer 34

jądro i jąderko

Question 35

Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA II?

Answer 35

jądro

Question 36

Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA III?

Answer 36

jądro

Question 37

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza I?

Answer 37

pre-rRNA (z wyjątkiem 5S rRNA)

Question 38

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza II?

Answer 38

pre-mRNA (hnRNA) i snRNA

Question 39

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza III?

Answer 39

pre-tRNA, 5S rRNA, snRNA i scRNA

Question 40

Jaką wrażliwość na α-amanitynę wykazują eukariotyczne polimerazy RNA?

Answer 40

polimeraza I - niewrażliwa polimeraza II - bardzo wrażliwa polimeraza III - wrażliwa

Question 41

Skąd pochodzi α-amanityna?

Answer 41

od trującego grzyba: Amanita phalloides

Question 42

Co transportuje hormony lipofilne?

Answer 42

białka osocza

Question 43

Z czym wiążą się hormony lipofilne, które dyfundowały przez błonę plazmatyczną?

Answer 43

z wewnątrzkomórowym receptorem białkowym

Question 44

Z czym wiąże się receptor po związaniu z hormonem lipofilnym?

Answer 44

regionem regulatorowym = sekwencją odpowiedzi hormonalnej (HRE)

Question 45

Do czego prowadzi połączenie dimeru HR (hormon-receptor) do HRE?

Answer 45

pobudza transkrypcję określonych genów

Question 46

Czym są paluszki cynkowe?

Answer 46

receptory hormonów steroidowych

Question 47

Co to jest zamek leucynowy?

Answer 47

motyw strukturalny warunkujący oddziaływanie białko-białko

Question 48

Z czym wiąże się zamek leucynowy?

Answer 48

DNA z wysoką zawartością zasadowych aminokwasów (Leu, Arg)

Question 49

Z czym może oddziaływać zamek leucynowy?

Answer 49

z ujemnie naładowanymi resztami fosforanowymi w DNA

Question 50

Kiedy jest przyłączana czapeczka do mRNA?

Answer 50

jeszcze przed zakończeniem transkrypcji

Question 51

Z czym oddziałuje czapeczka mRNA?

Answer 51

z rybosomami

Question 52

Jakie znaczenie funkcjonalne ma ogon poli(A)?

Answer 52

jest ważny dla przenoszeie mRNA z jądra do cytozolu

Question 53

Co występuje na końcu 5' tRNA?

Answer 53

zwykle koniec 5' jest ufosforylowany

Question 54

Co występuje na końcu 3' tRNA?

Answer 54

sekwencja 5'-CCA-3'

Question 55

Jaką funkcję pełni sekwencja 5'-CCA-3' na końcu 3' tRNA?

Answer 55

przyłącza aminokwas

Question 56

Z jakich etapów składa się synteza pierwotnego transkryptu RNA?

Answer 56

inicjacja, elongacja i terminacja

Question 57

Czy do syntezy RNA konieczny jest primer?

Answer 57

nie

Question 58

Czy podczas kopiowania RNA musi zajść replikacja całej cząsteczki?

Answer 58

nie

Question 59

Czy podczas transkrypcji RNA jest sprawdzana poprawność odczytu?

Answer 59

nie

Question 60

W jakim kierunku odczytywana jest nić matrycowa DNA?

Answer 60

3'→5'

Question 61

W jakim miejsce polimeraza RNA rozpoczyna trankrypcję?

Answer 61

na promotorze

Question 62

Co to jest jednostka transkrypcji?

Answer 62

region DNA zawierający sygnały inicjacji, elongacji i terminacji

Question 63

W którym miejscu od rozpoczęcia transkrypcji i jakie charakterystyczne sekwencje stanowią promotory?

Answer 63

- 35: 5'-TGTTGACA-3' | - 10: 5'-TATAAT-3'

Question 64

Czym charakteryzuje się sekwencja 5'-TATAAT-3' w pozycji -10 od miejsca rozpoczęcia transkrypcji na nici matrycowej?

Answer 64

ma niską temperaturę topnienia

Question 65

Co to jest TATA box?

Answer 65

sekwencja 5'-TATAAT-3' w pozycji -10 od miejsca rozpoczęcia transkrypcji na nici matrycowej

Question 66

Co umożliwia niska temperatura topnienia TATA box?

Answer 66

uzyskanie dostępu do nici matrycowej bezpośrednio za sekwencją startu transkrypcji przez polimerazy RNA

Question 67

Jaki enzym rozpoznaje sekwencje -35 i -10?

Answer 67

holopolimeraza RNA