Kolokwium II - nukleotydy i nukleozydy Flashcards
(214 cards)
1
Q
Czym są nukleotydy?
A
jednostki monomeryczne, z których zbudowane są kwasy nukleinowe
2
Q
Jaką funkcję (poza strukturalną dla kwasów nukleinowych) pełnią nukleotydy?
A
- wchodzą w skład koenzymów
- donory grup fosforylowych (np. ATP, GTP)
- donory cukrów (np. cukry z UDP lub GDP)
- donory lipidów (CDP-acyloglicerol)
- regulatorowa
3
Q
Co zaliczamy do nukleotydów regulatorowych?
A
przekaźniki drugorzędowe cAMP i cGMP
4
Q
Co reguluje szybkość mitochondrialnej fosforylacji oksydacyjnej?
A
stężenie ADP
5
Q
Które pochodne nukleotydów biorą udział w allosterycznej regulacji aktywności enzymatycznej?
A
ATP, AMP, CTP
6
Q
Gdzie stosujemy syntetyczne analogi puryn i pirymidyn, zawierające halogeny, tiole lub dodatkowe atomy azotu?
A
w chemioterapii nowotworów i AIDS oraz w celu immunosupresji podczas transplantacji narządów
7
Q
Czym są puryny i pirymidyny?
A
związki heterocykliczne, zawierające azot
8
Q
Które związki stanowią większą cząsteczkę: puryny czy pirymidyny?
A
puryny
9
Q
Jaki jest kierunek numeracji atomów węgla w cząsteczkach puryn?
A
przeciwny do ruchu wskazówek zegara
10
Q
Jaki jest kierunek numeracji atomów węgla w cząsteczkach pirymidyn?
A
zgodny z ruchem wskazówek zegara
11
Q
Co ułatwia planarny charakter puryn i pirymidyn?
A
warstwowe ułożenie i bliskie oddziaływania, które stabilizują dwuniciową helisę DNA
12
Q
Jakie formy tautomerów puryn i pirymidyn są uprzywilejowane w warunkach fizjologicznych?
A
formy amino- i okso-
13
Q
Czym są nukleozydy?
A
pochodne puryn i pirymidyn, zawierające cząsteczkę cukru związaną z atomem azotu heteropierścienia
14
Q
Jaki cukier występuje w rybonukleozydach?
A
D-ryboza
15
Q
Jaki cukier występuje w deoksyrybonukleozydach?
A
2-deoksy-D-ryboza
16
Q
Jakim wiązaniem cząsteczka cukru łączy się z heterocykliczną zasadą?
A
wiązaniem β-N-glikozydowym
17
Q
Z którym atomem azotu puryny zazwyczaj łączy się cząsteczka cukru?
A
N-9
18
Q
Z którym atomem azotu pirymidyny zazwyczaj łączy się cząsteczka cukru?
A
N-1
19
Q
Czym są mononukleotydy?
A
nukleozydy z grupą fosforylową zestryfikowaną do grupy hydroksylowej cukru
20
Q
Dlaczego w nazwie nukleotydów pomijamy 5’ ?
A
ponieważ większość nukleotydów jest typu 5’
21
Q
Jakie wiązania występują między dodatkowymi grupami fosforanowymi przyłączanymi do mononukleotydu?
A
wiązania bezwodnikowe
22
Q
W jakich konformacjach występują nukleotydy i nukleozydy?
A
syn i anty
23
Q
Co ogranicza rotację wokół wiązania β-N-glikozydowego w cząsteczkach nukleotydów i nukleozydów?
A
zawada przestrzenna ze strony heterocyklicznej zasady
24
Q
Jaka konformacja nukleotydów i nukleozydów przeważa w przyrodzie?
A
forma anty
25
Jakie wyróżniamy zasady azotowe wchodzące w skład nukleotydów i nukleozydów i jakimi skrótami je oznaczamy?
```
adenina - A
guanina -G
cytozyna - C
tymina - T
uracyl - U
```
26
Jaki skrót używamy by wskazać, że cukrem w cząsteczce jest 2'-deoksy-D-ryboza?
przedrostek "d"
27
Jakie dodatkowe puryny mogą występować w DNA i RNA?
- 5-metylocytozyna DNA bakterii i człowieka
- 5-hydroksymetylocytozyna (kwasy nukleinowe bakterii i wirusów)
- N-metylowana adenina w mRNA ssaków
- N-metyowana guanina w mRNA ssaków
- pseudourydyna
28
Jakie znaczenie mają N-metylowane guanina i adenina?
rozpoznawanie oligonukleotydów i regulacja okresu półtrwania kwasów rybonukleinowych
29
Jakie nukleotydy występują w komórkach w stanie wolnym?
- hipoksantyna
- ksantyna
- kwas moczowy
30
Jakie znaczenie dla komórki mają obecne w niej w stanie wolnym nukleotydy?
są pośrednikami w katabolizmie adeniny i guaniny
31
Jakie znamy metylowane heterocykliczne zasady występujące w roślinach?
- pochodne ksantyny
- kofeinę w kawie
- teofilinę w kawie
- teobrominę w kakao
32
Jak powstaje pseudourydyna?
w wyniku potranslacyjnej modyfikacji, poprzez połączenie D-rybozy z węglem C-5 uracylu wiązaniem węgiel-węgiel (zamiast β-N-glikozydowym)
33
W jakich procesach fizjologicznych biorą udział nukleotydy?
- synteza białek i kwasów nukleinowych
- kaskady regulatorowe
- transdukcja sygnałów wewnątrz- i międzykomórkowych
34
Jaki jest potencjał transferu bezwodników kwasowych w odróżnieniu od estrów?
wysoki
35
Ile wynosi ΔG0 dla hydrolizy obu końców reszt fosforanowych (β i γ) wszystkich trifosforanów nukleozydów?
ok. -30 kJ/mol
36
Która reszta trójfosforanów nukleozydów najczęściej bierze udział w reakcjach jako czynnik transferu grup?
reszta γ
37
Z jakim procesem pod względem energii jest sprzężone rozerwanie wiązania typu bezwodnika kwasowego?
procesem wysoce endoergicznym
38
Jakie znaczenie fizjologiczne na 3'fosforano-5'fosforosiarczan adenozyny?
donor grup siarczanowych dla proteoglikanów i siarczanowych koniugatów leków
39
Jakie znaczenie fizjologiczne ma S-adenozylometionina?
jest donorem grupy metylowej
40
Jaką funkcję pełni GTP?
jest allosterycznym regulatorem i źródłem energii w syntezie bialek
41
Jaką funkcję pełni cykliczny GMP?
jest przekaźnikiem drugorzędowym w odpowiedzi na tlenek azotu podczas relaksacji mięśni gładkich
42
Jaką funkcję pełnią pochodne UDP-cukru?
uczestniczą w epimeryzacji cukrów i biosyntezie glikogenu, dwucukrów glukozylowych i oligosacharydów występujących w glikoproteinach i proteoglikanach
43
Jaką funkcję pełni UDP-kwas glukuronowy?
tworzy koniugaty bilirubiny w moczu i koniugaty wielu leków (np. aspiryny)
44
Jaką funkcję pełni CTP?
bierze udział w biosyntezie fosfoglicerydów, sfiengomielin i innych podstawowych sfingozyn
45
Jakim ładunkiem są obdarzone nukleozydy i wolne nukleotydy?
nie są obdarzone ładunkiem
46
Jaki wpływ na ładunek nukleotydów ma przyłączenie do ich cząsteczki reszt fosforanowych?
reszty fosforanowe zapewniają ujemny ładunek w fizjologicznym pH
47
Jakie znaczenie dla nukleotydów ma zmiana wartości pH?
zmiana pH może powodować, że nukleotyd będzie donorem lub akceptorem protonów
48
Jakie światło absorbują nukleotydy, nukleozydy i polinukleotydy?
światło ultrafioletowe
49
Jakie wiązanie umożliwia absorpcję światła ultrafioletowego przez nukleotydy, nukleozydy i polinukleotydy?
wiązania podwójne sprzężone w heterocyklicznych zasadach purynowych i pirymidynowych
50
Co towarzyszy pochłanianiu światła ultrafioletowego przez nukleotydy obecne w DNA?
przemiany chemiczne
51
Od czego są zależne widma absorbancji światła przez kwasy nukleinowe?
od pH
52
Jaką długość fali absorbują wszystkie zwykłe nukleotydy w pH 7?
260 nm
53
Jak wyraża się stężenie nukleotydów i kwasów nukleinowych?
w jednostkach gęstości optycznej (OD) przy długości fali 260 nm
54
Gdzie znajdują zastosowanie syntetyczne analogi nukleotydów?
w chemioerapii
55
W jaki sposób powstają syntetyczne analogi nukleotydów?
przez zmianę pierścienia heterocyklicznego lub cząsteczki cukru
56
Jak jest realizowane toksyczne działanie syntetycznych analogów nukleotydów?
- zahamowanie przez lek swoistych enzymów niezbędnych do biosyntezy kwasów nukleinowych
- wbudowanie metabolitu takiego leku w kwasy nukleinowe (gdzie wpływa na parowanie zasad)
57
Do leczenia jakich schorzeń stosowany jest allopurinol?
hiperurykemia i skaza moczanowa
58
W jaki sposób działa allopurinol?
hamuje biosyntezę puryn de novo i hamuje aktywność oksydazy ksantynowej
59
Jaki związek będący pochodną nukleotydów stosujemy w chemioterapii nowotworów?
cytrabina
60
Jaki związek będący pochodną nukelotydów stosujemy w czasie transplantacji w celu stłumienia procesów immunologicznych?
azatioprynę
61
Do jakiego związku jest katalizowana azatriopryna?
do 6-merkaptopuryny
62
W jaki sposób powstaje fosfodiester?
gdy 5'-fosforan nukleotydu wiąże się z grupą alkoholową (wiązanie estrowe)
63
W jaki sposób powstaje dinukleotyd?
gdy 5'fosforan nukleotydu wiąże się z 3'-OH znajdjącą się w cząsteczce pentozy drugiego nukleotydu
64
Jak nazywa się wiązanie pomiędzy dwoma cząsteczkami nukleotydów?
fosfodiestrowe 3'→5'
65
W jaki sposób można przedstawić tworzenie cząsteczki dinukleotydu?
jako eliminację cząsteczki wody towarzyszącą łączeniu się pary monomerów
66
Jaki proces w warunkach biologicznych jest bardziej uprzywilejowany niż eliminacja cząsteczki wody towarzyszącemu łączeniu się par monomerów?
hydroliza wiązań fosfodiestrowych
67
Dlaczego mimo, że hydroliza wiązań fosfodiestrowych jest bardziej uprzywilejowana proces ten zachodzi nieznacznie?
ze względu na dużą barierę energetyczną
68
Kiedy może zajść hydroliza wiązań fosfodiestrowych?
kiedy proces jest katalizowany przez fosfodiesterazy
69
Dlaczego RNA jest znacznie mniej stabilny niż DNA?
ponieważ grupa 2'-hydroksylowa, nieobecna w DNA podczas hydrolizy wiązania fosfodiestrowego 3'→5' zachowuje się jak nukleofil
70
Polinukleotydy są cząsteczkami polarnymi czy niepolarnymi?
polarnymi (zawierają koniec 5' i 3')
71
Po której stronie sekwencji polinukleotydu umownie zapisuje się koniec 5'?
po lewej
72
Który koniec sekwencji polinukleotydu umownie zapisuje się po prawej stronie?
3'
73
Co w terminologii mononukleotydów oznacza " ' " ?
miejsce reszty fosforanowej w cząsteczce cukru
74
Co tworzą cząsteczki mononukleotydów sprzężone wiązaniem fosfodiestrowym 3'→5'?
polinukleotydy
75
Co to jest gen?
podstawowa jednostka informacji genetycznej
76
Co kontrolują geny?
syntezę różnych typów RNA
77
Przez co jest kontrolowana replikacja i funkcja genów?
przez różnorodne produkty genowe, często przy współudziale składników różnych szlaków transdukcji sygnałów
78
Z jakich czterech podjednostek składa się DNA?
- deoksyadenylan
- deoksyguanylan
- deoksycytydylan
- deoksytymidylan
79
Co to jest kod genetyczny?
sekwencja monomerów w DNA
80
Dwuniciowa cząsteczka DNA jest prawo- czy lewoskrętna?
prawoskrętna
81
Jakie siły utrzymują strukturę dwuniciowej cząsteczki DNA?
- wiązania wodorowe
- oddziaływania hydrofobowe
- oddziaływania van der Waalsa
82
Jakie pary zasad są do siebie komplementarne?
A i T
| C i G
83
Co to znaczy, że dwa pasma DNA są do siebie przeciwległe?
to znaczy, że jedna nić biegnie w kierunku 5'→3', a druga w kierunku 3'→5'
84
Jak nazywamy obie nici DNA?
- nić matrycowa (niekodująca)
| - nić kodująca
85
Na której nici DNA mieści się informacja genetyczna?
na nici matrycowej (niekodującej)
86
Czym różni się nić kodująca DNA od transkryptu RNA nici matrycowej?
tylko tym, że zawiera tyminę a nie uracyl
87
W jakich formach istnieje dwuniciowy DNA?
A, B, C, D, E, Z
88
Która forma dwuniciowego DNA zazwyczaj występuje fizjologicznie i czym się ona charakteryzuje?
forma B, małe stężenie soli i duży stopień uwodnienia
89
Ile par zasad zwiera pojedynczy skręt formy B DNA?
10 pz
90
Ile wynosi długość jednego skrętu formy B DNA?
3,4 nm
91
Ile wynosi średnica jednego skrętu formy B DNA?
2nm
92
Ile wiązań wodorowych stabilizuje parę A-T?
dwa
93
Ile wiązań wodorowych stabilizuje parę G-C?
trzy
94
O ile mocniejsze jest wiązanie G-C niż A-T?
około 50%
95
Które regiony DNA są bardziej odporne na denatruację?
regony zawierające dużą liczbę wiązań C-G
96
Kiedy może dojść do rozdzielenia dwuniciowej struktury DNA?
w podwyższonej temperaturze lub przy zmniejszonym stężeniu soli
97
Co poza rozdzieleniem dwóch nici DNA dzieje się podczas denaturacji?
zasady zmieniają wzajemne położenie, będąc stale jeszcze związane jako polimer
98
Co to jest efekt hiperchromowy?
wzrost absorbancji cząsteczki DNA podczas jej denaturacji
99
Co to jest efekt typu "stacking"?
oddziaływania między sąsiadującymi parami zasad
100
Jaką lepkość ma cząsteczka DNA w roztworze?
dużą
101
Co się dzieje z lepkością cząsteczki wskutek denaturacji?
maleje
102
Dzięki czemu cząsteczka DNA może tworzyć sztywne pałeczkowate twory?
dzięki efektowi typu stacking i wiązaniom wodorowym między zasadami
103
Co to jest temperatura topnienia cząsteczki DNA?
środkowy punkt zakresu temperatury w którym nici danej cząsteczki DNA oddzielają się od siebie
104
Od czego zależy temperatura topnienia cząsteczki DNA?
od składu zasad DNA i stężenia soli w roztworze
105
Jak wpływa 10x większe stężenie jednowartościowych kationów na temperaturę topnienia cząsteczki DNA?
podnosi ją o 16,6 ℃
106
Jak wpływa formamid na temperaturę cząsteczki DNA i dlaczego?
zmniejsza wartość Tm, ponieważ destabilizuje wiązania wodorowe między zasadami
107
Jakie zastosowanie ma formamid w doświadczeniach z rekombinowanym DNA?
pozwala na oddzielenie nici w znacznie niższej temperaturze i minimalizuje ich pęknięcia (które występują w wysokich temperaturach)
108
Co to jest hybrydyzacja DNA?
zjawisko renaturacji (reasocjacji) oddzielonych nici DNA, gdy zostanie osiągnięta właściwa temperatura i stężenie soli
109
Od czego zależy szybkośc reasocjacji?
od stężenia komplementarnych nicni
110
Co jest przykładem fizjologicznego zjawiska renaturacji DNA?
reasocjacja dwóch nici DNA po replikacji
111
Jakie procedury umożliwiają specyficzną i czułą identyfikację hybryd w mieszaninach DNA lub RNA?
elektroforeza żelowa (oddzielenie hybrydowych cząsteczek różniących się wielkością),
radioaktywne lub fluorescencyjne metody znakowania cząsteczek,
wykrywanie za pomocą Southern (DNA/cDNA) blotting i Northern (RNA/DNA) blotting
112
Jakie rowki ma cząsteczka DNA?
rowek mniejszy i rowek większy
113
Dzięki czemu białka mogą rozpoznawać swoiste sekwencje nukleotydowe i wiązać się z nimi bez rozrywania sparowanych zasad w dwuniciowej cząsteczce DNA?
białka oddziałują w obrębie rowków DNA z eksponowanymi atomami nukleotydów
114
Gdzie występują koliste cząsteczki DNA?
w organizmach bakterii, bakteriofagów, wielu wirusach zwierzęcych zawierających DNA i niektórych organellach (mitochondria)
115
Czy związanie końców DNA zaburza polarność czasteczki?
nie, tylko eliminuje wolne grupy hydroksylowe i fosforylowe w położeniach 3' i 5'
116
W jakiej postaci istnieją koliście zamknięte cząsteczki DNA?
- rozluźniona
| - silnie skręcona
117
Kiedy występuje nadmierne skręcenie koliście zamkniętej cząsteczki DNA?
czy kolista cząsteczka jest skręcona wokół własnej osi lub gdy liniowa cząsteczka DNA, której końce zostają zakotwiczone zakotwiczone ulega skręceniu
118
Czy nadmierne skręcenie kolistej cząsteczki DNA wymaga energii?
tak
119
Co powoduje nadmierne skręcenie kolistej cząsteczki DNA?
wystąpienie napięć w czasteczce
120
Jaki stosunek ma liczba superskrętów do napięcia w kolistej cząsteczce DNA?
im większa ilość superskrętów tym większe napięcie
121
Kiedy występują ujemne superzwoje?
gdy prawoskrętna cząsteczka dwuniciowej helisy (występująca w B-DNA) jest skręcona w kierunku przeciwnym do ruchu wskazówek zegara
122
Jak nazywa się DNA w którym występują ujemne superzwoje?
DNA rozwinięte
123
Co się dzieje z energią rozwiniętego DNA?
jest magazynowana w superskrętach
124
Jaka postać DNA jest preferowana w układach biologicznych?
superskręty
125
Jak działają topoizomerazy?
katalizują topologiczne zmiany DNA, mogą wprowadzać rozluźnienie albo superskręty
126
Jak nazywa się najlepiej poznana topoizomeraza i jak ona działa?
giraza bakteryjna, która wprowadza ujemne superskręty w DNA
127
Gdzie w medycynie są wykorzystywane homologi girazy bakteryjnej?
w chemioterapii nowotworów
128
Jaką funkcję pełni informacja genetyczna zmagazynowana w sekwencji nukleotydowej DNA?
- jest źródłem informacji dla syntezy wszystkich cząsteczek białkowych komórki i organizmu
- dostarcza informacji dziedziczonej przez komórki potomne i potomstwo
129
Co jest warunkiem spełnienia obu funkcji DNA?
występowanie DNA w roli matrycy (do transkrypcji informacji na RNA i do replikacji informacji dla dwóch siostrzanych cząsteczek DNA)
130
W jaki sposób zachodzi replikacja DNA według Wastona i Cricka?
w sposób semikonserwatywny
131
Czym różni się RNA od DNA?
- cząsteczka cukru (ryboza a nie 2-deoksyryboza)
- uracyl zamiast tyminy
- pojedyncza nić zamiast podwójnej
- ilość guaniny nie musi być równa ilości cytozyny, ani ilość adeniny nie musi się równać ilości uracylu
- RNA może być hydrolizowany
132
Czy struktura RNA jest zawsze jednoniciowa?
w pewnych sekwencjach zawierających komplementarne zasady w odwrotnej polarności jest zdolna do zawinięcia się na samej sobie
133
Dlaczego RNA może ulegać hydrolizie a DNA nie?
ponieważ DNA nie ma grup 2'-hydroksylowych
134
W jakim środowisku RNA może ulegać hydrolizie?
w środowisku zasadowym
135
Co powstaje w wyniku hydrolizy RNA?
cykliczne 2',3'-diestry mononukleotydów
136
Gdzie wykorzystujemy labilność RNA w stosunku do środowiska zasadowego?
w diagnostyce i analizie
137
Co to jest mRNA?
informacyjny RNA = cząsteczki cytoplazmatycznego RNA, które służą jako matryce do biosyntezy DNA, przenosząc informację z DNA do ośrodków syntetyzujących białko
138
Co to jest rRNA?
rybosomalny RNA = odgrywa rolę strukturalną (rybosomy)
139
Co to jest tRNA?
transferowy / transportujący RNA = cząsteczki łącznikowe do translacji informacyjnego RNA
140
Czym są rybozymy?
cząsteczki RNA posiadające wewnętrzną aktywność katalityczną
141
Z czym wiąże się aktywność katalityczna rybozynów?
z cieńciem kwasu nukleinowego
142
Co się dzieje ze znaczną częścią RNA jeszcze w obrębie jądra?
jest degradowana i nigdy nie służy jako jednostka strukturalna lub informacyjna w cytoplazmie komórkowej
143
Co to jest snRNA?
małe jądrowe RNA (small nuclear RNA)
144
Ile nukleotydów zawierają snRNA?
90-300
145
Jak działa odwrotna transkryptaza?
przepisuje RNA na DNA, w wyniku czego powstaje dwuniciowa kopia DNA genomu RNA
146
Jaką polarność ma nić matrycowa?
3' do 5'
147
Jaką polarność ma transkrypt RNA?
taką jak nić kodująca= 5' do 3'
148
Co jest przyłączane do końca 5' mRNA?
czapeczka = kapturek
149
Z czego jest złożona czapeczka przyłączona do mRNA?
trifosforan 7-metyloguaniny
150
Jakie wewnętrzne nukleotydy często występują w mRNA?
6-metyloadenylany i inne metylowane nukleotydy 2'-O-rybozy
151
Jaką rolę pełni czapeczka w czasteczce mRNA?
- rozpoznawanie mRNA przez mechanizm transkrypcyjny
| - pomaga w stabilizowaniu mRNA
152
W jaki sposób czapeczka pomaga w stabilizowaniu mRNA?
blokuje atak 5'-egzonukleaz
153
Od którego końca mRNA rozpoczyna się translacja?
od końca 5' = otulonego czapeczką
154
Co jest przyłączone do końca 3' mRNA?
ogon poli(A)
155
Z czego jest zbudowany ogon poli(A)?
z 200-500 nukleotydów adenylowych
156
Jaką punkcję pełni ogon mRNA?
PRAWDOPODOBNIE utrzymuje stabilność swoistych mRNA wewnątrz komórki, chroniąc przed atakiem 3'-egzonukleaz
157
Czy wszystkie cząsteczki mRNA posiadają ogon poli(A)?
nie
158
Czy czapeczka i ogon są kodowane na matrycy?
nie
159
Jakie wiązanie ogona poli(A) umożliwia rozdzielenie cząsteczek mRNA zawierających ogon od pozostałych cząsteczek mRNA bez ogona i innych rodzajów RNA?
wiązania na zasadzie parowania zasad z polimerami oligodeoksytymidyny związanej ze stałym podłożem (np. celulozą)
160
W jaki sposób powstają czapeczki mRNA?
w wyniku przekształceń prekursorowej cząsteczki przed wejściem do cytoplazmy
161
Co to jest hnRNA?
jądrowe heterogenne RNA
162
Co stanowi czwartą klasę cząsteczek RNA w jądrach komórek ssaków?
bezpośrednie produkty transkrypcji genów
163
Jaką funkcję pełnią hnRNA?
ulegają przemianie do mRNA, które wnikają do cytoplazmy
164
Z ilu nukleotydów składa się tRNA?
74-95
165
Gdzie powstaje tRNA?
w jądrze cząsteczki prekursorowej
166
Ile rodzajów tRNA występuje w każdej komórce?
przynajmniej 20
167
Jaki jest stosunek tRNA do kompatybilności z aminokwasami?
przynajmniej jedno tRNA (a często kilka) odpowiada każdemu z 20 aminokwasów
168
Co umożliwia struktura pierwszorzędowa cząsteczki tRNA?
sfałdowanie
169
Dzięki czemu możliwe jest wytworzenie drugorzędowej struktury cząsteczki tRNA i co ona przypomina?
dzięki wewnątrzcząsteczkowej komplementarności zasad,
| przypomina liść koniczyny
170
Ile ramion posiada każda cząsteczka tRNA i jak się one nazywają?
1. ramię akceptorowe
2. ramię antykodonowe
3. ramię D
4. ramię TψC
5. ramię dodatkowe
171
Z czego składa się ramię akceptorowe tRNA?
z łodyżki utworzonej ze sparowanych zasad
172
Jaką sekwencją kończy się łodyżka ramienia akceptorowego tRNA?
CpCpAoh
173
Kiedy do łodyżki tRNA dodawane są trzy końcowe nukleotydy CpCpAoh?
po tranksrypcji
174
Jaki enzym umożliwia przyłączenie CpCpAoh do łodyżki tRNA?
transferaza nuklotydowa
175
Jakim wiązaniem i gdzie przyłączają się aminokwasy do cząsteczki tRNA?
wiązaniem estrowym do grupy 3'-hydroksylowej reszty adenozylowej ramienia akceptorowego (dzięki swoim grupom karboksylowym)
176
Co wyznaczają specyficzność cząsteczki tRNA?
ramiona D, TψC i dodatkowe
177
tRNA komórek eukariotycznych czy prokariotycznych jest bardziej trwałe?
komórek prokariotycznych
178
mRNA komórek eukariotycznych czy prokariotycznych jest bardziej trwałe?
komórek eukariotycznych
179
Co to jest rybosom i jaką funkcję pełni?
cytoplazmatyczna struktura nukeoproteinowa, która bierze udział w mechanizmie syntezy białek na matrycach mRNA
180
Czym są polisomy?
cząsteczka mRNA z którą oddziałuje wiele rybosomów
181
Jaką masą cząsteczkową i szybkością sedymentacji charakteryzują się rybosomy ssaków?
4,2·10e6, 80S
182
Z jakich podjednostek, o jakiej masie cząsteczkowej i szybkości sedymentacji składają się rybosomy ssaków?
mała podjednostka: 1,4·10e6, 40S
| duża podjednostka: 2,8·10e6, 60S
183
Jakie cząsteczki zawiera podjednostka 60S rybosomów?
- 5S rRNA
- 5,8S rRNA
- 28S rRNA
- ponad 50 swoistych polipeptydów
184
Jakie cząsteczki zawiera podjednostka 40S rybosomów?
- 18S rRNA
| - ok. 30 łańcuchów polipeptydów
185
Skąd pochodzą cząsteczki rRNA?
5S rRNA posiada własną prekursorową strukturę
pozostałe pochodzą z przekształcenia w jąderku cząsteczki prekursorowej 45S RNA
186
W jakiej postaci istnieje większość małocząsteczkowych RNA i gdzie są one rozmierzczone w komórce?
w postaci rybonukleoprotein w jądrze lub cytoplazmie (lub w obu tych przedziałach)
187
Jaką rolę pełni snRNA?
jest ściśle związane z przetwarzaniem mRNA i regulacją genów
188
Jakie snRNA jest związane z usuwaniem intronów i przekształcaniem hnRNA w mRNA/
U1, U2, U4, U5, U6
189
Jaką rolę pełni U7 snRNA?
bierze udział w tworzeniu prawidłowego końca 3' histonowego mRNA (który nie zawiera ogona)
190
Jaką rolę pełni 7SK RNA?
przyłącza się do wielu białek, tworząc kompleks rybonukeoproteinowy, modulujący elongację mRNA przez polimerazę RNA II
191
Co to jest miRNA?
mikro RNA należące do podzbioru małocząsteczkowych RNA
192
Co to jest siRNA?
małe interferujące RNA należące do podzbioru małocząsteczkowych RNA
193
Jaką funkcję pełnią miRNA i siRNA?
hamują ekspresję genów poprzez zmniejszanie wytwarzania specyficznych białek
194
Z ilu nukleotydów składa się miRNA i siRNA?
21-25
195
Jak powstaje miRNA?
w wyniku nukeolitycznego przetwarzania produktów oddzielnych genów / jednostek transkrypcyjnych
196
Jak wyglądają i z ilu nukleotydów składają się perkursory miRNA?
jednoniciowe o rozbudowanej strukturze drugorzędowej, składające się z 500-1000 nukleotydów
197
Co tworzą dojrzałe miRNA w wyniku hybrydyzacji?
niedoskonałe dupleksy RNA-RNA ze specyficznymi docelowymi mRNA
198
W jakim miejscu docelowego mRNA miRNA tworzą z nimi dupelksy?
w obrębie nieulegających translacji regionów 3'
199
Do czego prowadzi powstanie dupleksu z miRNA w obrębie nieulegającym translacji regionu 3' mRNA?
do zahamowania translacji
200
Jak powstaje siRNA?
w wyniku nukleolitycznego, specyficznego przecięcia większych dwuniciowych cząsteczek RNA
201
Co tworzą dojrzałe siRNA w wyniku hybrydyzacji?
doskonałe hybrydy RNA-RNA
202
W jakim miejscu docelowego mRNA siRNA tworzą dupleksy?
w dowolnym miesjcu mRNA
203
Dlaczego tworzenie dupleksów RNA-RNA przez mRNA i siRNA prowadzi do ograniczenia wytwarzania określonych białek?
ponieważ kompleksy siRNA-mRNA ulegają degradacji (według specjalnych mechanizmów nukleolitycznych)
204
Jak nazywają się organelle w których kompleks siRNA-mRNA ulega całkowitej lub częściowej degradacji?
ciało P
205
Jak nazywa się grupa enzymów zdolna do degradacji kwasów nukleinowych?
nukleazy
206
Jak nazywamy nukleazy wykazujące specyficzność do kwasu deoksyrybonukleinowego?
deoksyrybonukleazy
207
Jak zawywamy nukleazy wykazujące specyficzność do RNA?
rybonukleazy
208
Jaką funkcję pełnią endonukleazy?
przecinają wewnętrzne wiązania fosfodiestrowe
209
Do którego kwasu nukleinowego wykazują powinowactwo endonukleazy?
do obu
210
Jakie końce powstają w wyniku działania endonukleaz?
3'-hydroksylowe i 5'-fosforylowe
lub 3'-fosforylowe i 5'-hydroksylowe
211
Czym są endonukleazy restrykcyjne?
endonukleazy, zdolne do rozpoznawania specyficznych sekwencji w obrębie DNA
212
Jak działają egzonukleazy?
hydrolizują nukleotyd znajdujący się na końcu cząsteczki
213
W jakim kierunku działają egzonukleazy?
wyłącznie jednokierunkowo (albo 3'→5' lub 5'→3')
214
Kiedy w TMP występuje ryboza zamiast deoksyrybozy?
gdy UMP w utworzonym uprzednio tRNA jest metylowany przez S-adenozylometioninę
