Lezione 54: Genomica Del Cancro

Question 1

Quali sono i 10 segnali per distinguere una cellula cancerosa da una normale secondo il paper HALLMARKS DEL CANCRO?

Answer 1

1)instabilità genetica (aumento numer di c cromosomi)

2) proliferazione incontrollata (perdita di inibizione da contatto)

3)perdita dei checkpoint del ciclo cellulare

4)resistenza all’apoptosi—->2 situazioni
*aumenta crescita cellulare ma si mantiene l’apoptosi
*aumenta la crescita cellulare e si perde l’apoptosi

5)resistenza alla senescenza replicativa

6)alterazione del metablismo energetico —-> effetto warburg

7)aumento angiogenesi

8)sfuggire al sistema immunitario—->
*non hanno antigene (perdita di antigenicità)
*gli anticorpi non riconoscono antigene (perdita di immunogenicità)
*creazione di un microambiente immunosoppressore (creano ambiente che non induce una risposta immunitaria)

9)invasione e metastasi

10) induzione di infiammazione pro tumorale

Question 2

Quali sono gli altri 4 punti per individuare le cellule tumorali (che sono state aggiunte all’Hallmarks del cancro in seguito alla prima pubblicazione)?

Answer 2

11)plasticità fenotipica—-> le cellule tumorali si possono differenziare, bloccare la differenziazione o transdifferenziare (cambiare tipo cellulare, diventando un’altra cellula tumorale)

12)riprogrammazione epigenetica non mutazionale

13)cellule senescenti—-> nei tumori ci sono cellule senescenti che contribuiscono alla proliferazione cellulare

14)microbiomi polimorfici—-> possono influenzare la crescita del tumore

Question 3

Come si può studiare la genomica del cancro?

Answer 3

-identificazione tramite cariotipo—-> identifica solo le mutazioni più grandi (es. traslocazioni).
Individua solo le mutazioni driver

-clinical genomic profiling—-> identifica anche le mutazioni non visibili al microscopio (es. puntiformi).
Serve per identificare sia le mutazioni driver che quelle passenger e per trovare la terapia genica migliore.
Usa tecniche di next generation sequencing

Question 4

Dimmi
Causa
Come si identifica
Terapia
Della leucemia mieloide cronica

Answer 4

-è causata dalla presenza del cromosoma Philadelphia

-si identifica dal cariotipo del paziente

-terapia: IMATINIB (si lega alla proteina mutata e la inibisce)

Question 5

Come si forma il cromosoma Philadephia?

Answer 5

dalla traslocazione bilanciata tra il cromosoma 9 (gene BCR) e 22 (gene ABL).

Così si ottiene il gene BCR-ABL—-> codifica per proteina tirosin-chinasi

Question 6

In che punto dell’oncogene avvengono le mutazioni
-drivers
-passenger

Answer 6

-drivers—-> avvengono in domini specifici (hot-spot)

-passenger—-> avvengono in un qualsiasi punto dll’oncogene (c’è bisogno di accumulare tante mutazioni affinchè si sviluppi il tumore)

Question 7

Cos’è il database ONCO KB?

Answer 7

Question 9

A cosa serve il profiling delle cellule germinali

Answer 9

Serve per capire la predisposizione di un individuo ad un tumore (es. gli ebrei sono più predisposti alla mutazione del gene BRCA1—> tumore alla mammella)

Question 10

Cos’è la single cell RNA sequencing?

Answer 10

Tecnica per studiare l’eterogenicità dei tumori