Mutaciones que afectan a regiones codificantes Flashcards

1
Q

Sustituciones

A

Mutaciones puntuales donde un nucleótido es sustituido por otro. Transiciones y transversiones

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Transiciones

A

Mutaciones que cambian un nucleótido de un grupo a otro del mismo grupo

A <—> G
C <—> T (U)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Transversiones

A

Cambio de nucleótido a uno de distinto grupo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Frecuencia transiciones y transversiones

A

Hay el doble de transiciones que de transversiones (es tremendamente frecuente la transición C → T)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

¿Por qué es tan frecuente la transición C —>T?

A

Muchas regiones del genoma: nucleótidos C seguidos de G (CpG islands). A menudo, en estas islas CpG, la C está metilada.—> desaminaciones espontáneas:

  • C: U = error detectable (no hay U en ADN), se cambia por C
  • C metilada: T = no se repara, no es “raro”
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Mutaciones sinónimas

A

Mutación resultante codificará para la = proteína, por la redundancia del código genético. En general son neutras, pero puede haber perjudiciales.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Mutaciones no sinónimas

A

Mutación da lugar a que se exprese una proteína distinta. El codón que se genera da lugar a un Aa diferente.
Pueden ser “min-sense” o “non-sense”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

“Mis-sense mutations”

A

Con cambio de significado, alterado.
Cambio de nucleótido —> Aa distinto.
Lo + habitual es que cambie la conformación de la proteínas / plegamiento —> pierde su función.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

“Non-sense mutations”

A

Mutaciones sin sentido
Cambio de nucleótido —> Aa resultante = codón de stop (UAA, UAG, UGA)
Proteína queda truncada

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Cómo una mutación sinónima puede resultar patológica

A

Nuestras células tienen mucha < concentración de ARNt para ese codón raro —> no hay suficientes moléc de ARNt para producir la prot a la velocidad necesaria.

La velocidad de traducción disminuye = plegamiento de prot se ve afectada

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Lo que se encuentra delante de “ : “ es

A

La secuencia de referencia

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Lo que viene tras “ : “ es

A

La descripción de lo que es la mutación en sí

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Cuando nos describen la mutación a nivel del DNA codificante (c), el nucleótido de coordenada +1 siempre es

A

La “A” del codón de inicio, ATG (codifica para metionina).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Cuando nos describen la mutación a nivel del DNA codificante (c), los nucleótidos que se encuentren upstream, en 5 ́ UTR

A

Se marcan con el signo negativo (-)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Cuando nos describen la mutación a nivel del DNA codificante (c), los nucleótidos que se encuentren downstream, en 3 ́UTR

A

Se marcan con un asterisco (*)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Cómo se indica una inserción

A

prefijo “ins”
Indicar el rango, entre qué nucleótidos se ha introducido

(14_15insT)

17
Q

Cómo se indica una deleción

A

Prefijo “del”
Indicar el rango que se elimina (indicando 1º y últ que se eliminan)

(1997_1998del)

Si solo se eliminan dos, se especifican que dos: 1997_1998delTG

18
Q

Mutaciones “frameshift”

A

Conllevan desplazamiento del marco de lectura.

19
Q

Marco de lectura abierta (ORF)

A

Secuencia de ADN entre un codón de inicio (AUG) y un codón de terminación.

Es el marco en el que el gen se puede traducir (grande = prot importante)

20
Q

Posibles marcos de lectura para un gen

A

3 (el 4º sería igual que el 1º pero con un Aa menos)
- +1 (empezamos por 1º nucleótido)
- +2 (empezamos por 2º nucleótido)
- +3 (empezamos por 3º nucleótido)

21
Q

Mutaciones que desplazan este marco de lectura

A

Inserciones y deleciones —> Frameshift mutations = prot truncadas (aparecen codones de parada)

(Solo si se insertan 1 o 2; si son 3 o múltiplos cambia la prot pero no el marco de lectura)

22
Q

Nomenclatura frameshift mutations

A

Añadimos “fs” al final

Es bueno decir también cuántos Aa después de que se inicie el frameshift, está el codón de parada, designado con prefijo “Ter” / asterisco (*).

(p.Tyr97SerfsTer23 o p.Tyr97Serfs*23)